| 年度 | 校级及以上集体奖励 |
2022年度
| 南京大学就业工作先进集体——医学院 |
| 南京大学招生工作先进集体——医学院 |
| 省级先进班集体——医学院2020级 |
| 南京大学优良班风建设示范点——2020级 |
| 南京大学优良班风建设示范点——2021级 |
| 校级社会实践优秀组织——医学院团委 |
| 校级社会实践十佳团队——“一沐阳光”南悦乡村支教团 |
| 校级社会实践十佳团队——颅内动脉瘤智能管家 |
| 校级社会实践优秀团队——“南彭友”社会实践小队 |
| 校级社会实践优秀团队——“悦伴金陵”南京暑托实践班 |
| 校级社会实践优秀团队——志爱社 |
| 校级社会实践优秀团队——禾爱 |
2021年度
| 南京大学学生工作先进集体——医学院学生工作办公室 |
| 南京大学就业工作先进集体——医学院 |
| 南京大学招生工作先进集体——医学院 |
| 江苏省党建工作样板支部——医学院本科支部 |
| 中国青年志愿者优秀组织奖——医学院青年志愿者协会 |
| 教育部中国大学生在线社会实践志愿服务十佳团队——南悦乡村支教团 |
| 团中央“投身乡村振兴、助力健康中国”专项实践优秀团队——南悦乡村支教团 |
| 中国大学生农村支教奖全国银奖——南悦乡村支教团 |
| 江苏省青年志愿服务行动组织奖——医学院团委 |
| 南京大学五四红旗团委——医学院团委 |
| 省级先进班集体——2019级 |
| 五四红旗团支部——2019级团支部 |
| 南京大学社会实践优秀组织奖——医学院团委 |
| 南京大学五四红旗团支部——医学院2019级团支部 |
| 南京大学十佳志愿服务项目——携手护“宁”：南京大学医学院支援核酸检测志愿服务项目 |
| 南京大学社会实践优秀报告——国家宏大叙事与个体生活的关系探索 |
| “互联网 ”大赛江苏省三等奖——基于3d打印的肠瘘支架 |
| 挑战杯江苏省三等奖——“中药益生菌发酵机制的研发及其在结直肠癌治疗中的应用” |